明珠小学位于集美区后溪镇集美大道西南侧，集美北大道、沈海高速以北。位于集美新城北站片区集美大道西客明珠小区东南侧，东侧隔集美大道为珩琦公寓，东南侧为规划建设中的明珠幼儿园和明珠社区服务中心，西南侧为碧溪绿道。建筑布局为2栋4层普通教学楼，2栋4层专用教学楼，1栋4层综合办公楼和1栋食堂体育馆综合楼。建成后可容纳学生36个班。

综合办公楼由办公室及两种或两种以上用途教室(如音乐、体育活动等)组成。学生食堂和体育馆位于地块北侧，组合成舒适的校园庭院，减少对教学区的干扰。
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按照教学需求，教学楼与辅助教学楼及配套用房以连廊相连，通过风雨连廊的设计使师生在雨天不需打伞即可到达教学区的任意地点。
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整体功能的合理布局，适应了各种性质的使用要求，引入通透空间的平面设计，使空间具有较高的灵活性和可变性，适应新时代教学持续发展的需要。